Eliška Šranková
Junior Researcher, Research Specialist
Medicinal Chemistry
Náš tým zkoumá základní mechanismy a převádí výsledky z laboratoře do klinické praxe — propojení preklinických modelů s klinickou perspektivou.
Výzkumný pracovník ICRC se zaměřením na translační medicínu. Propojuje preklinické poznatky s klinickou praxí napříč programy kardiologie, neurologie a onkologie.
Aktuálně vede / přispívá do interdisciplinárních projektů spojujících molekulární biologii, zobrazování a péči o pacienty ve Fakultní nemocnici u sv. Anny v Brně.
Výzkumná skupina
- Velikost týmu
- Velikost týmu: 8 výzkumníků
- Místo
- Místo: Building D3, Ground Floor
- Spolupracuje s
- Spolupracuje s MUNI Clinic
Vedoucí výzkumné skupiny
- doc. Mgr. Kamil Paruch, Ph.D.
Členové
Mgr. Gabriela Pavlíková
Research Assistant, Senior Research Coordinator
Prashantkumar Dineshbhai Khirsariya, Ph.D., MSc
Postdoctoral Researcher, Senior Research Specialist
RNDr. Marek Remeš, Ph.D.
Postdoctoral Researcher
doc. Mgr. Kamil Paruch, Ph.D.
Principal Investigator, Senior Research Team Leader
Mgr. Lukáš Maier, Ph.D.
Senior Postdoctoral Researcher
Mgr. Jakub Švenda, Ph.D.
Head Researcher
Mgr. Štěpán Havel
Research Specialist
Asistent týmu
Mgr. Gabriela Pavlíková
Administrativní podpora
Hlavní cíle
- Totální syntéza nových analogů forskolinu a testování jejich aktivity proti lidským adenylyl cyklázám.
- Identifikace nových inhibitorů nedostatečně prozkoumaných proteinových kináz.
- Vývoj SAR kolem stávajících proprietárních inhibitorů nukleáz MRE11 a Mus81; identifikace submikromolárních inhibitorů.
- Syntéza a biologické profilování nových karbocyklických C-nukleosidů.
Zaměření výzkumu
Výzkum v naší laboratoři se zaměřuje na vývoj syntetických metod a strategií pro přípravu strukturně netriviálních organických sloučenin pro aplikace v biomedicínském výzkumu. Naše projekty jsou zaměřeny na:
Vývoj účinných inhibitorů některých „nerutinních“ kináz (CLK, HIPK).
Syntézu nových modulátorů adenylyl cykláz na bázi forskolinů
Identifikaci inhibitorů vybraných opravných drah poškození DNA (nukleázy Mre11 a Mus81).
Přípravu nových chemických sond pro buněčnou diferenciaci a fluorescenčních sond pro biologické systémy.
Organickou syntézu organických sloučenin střední strukturní komplexity.
Medicinální chemii – optimalizaci raných “lead” sloučenin.
Technologické vybavení
- HPLC s UV, MS a CAD detekcí
- NMR spektrometr
- mikrovlnný reaktor
- vysokotlaký reaktor
- automatické purifikační systémy
Vybrané výsledky
- Khirsariya, P.; Pospíšil, P.; Maier, L.; Boudný, M.; Babáš, M.; Kroutil, O.; Mráz, M.; Vácha, R.; Paruch, K. Synthesis and profiling of highly selective inhibitors of methyltransferase DOT1L based on carbocyclic C-nucleosides. J. Med. Chem. 2022, 65, 5701.
- Tharra, P. R.; Mikhaylov, A.; Švejkar, J.; Gysin, M.; Hobbie, S. N.; Švenda, J. Short synthesis of (+)-actinobolin: Simple entry to complex small-molecule inhibitors of protein synthesis. Angew. Chem. Int. Ed. 2022, 61, e202116520.
- Němec, V.; Maier, L.; Berger, B.-T.; Chaikuad, A.; Drápela, S.; Souček, K.; Knapp, S.; Paruch, K. Highly selective inhibitors of protein kinases CLK and HIPK with the furo[3,2-b]pyridine core. Eur. J. Med. Chem. 2021, 215, 113299.
- Vojáčková, P.; Michalska, L.; Nečas, M.; Shcherbakov, D.; Bottger, E. C.; Šponer, J.; Šponer, J.; Švenda, J. Stereocontrolled Synthesis of (−)-Bactobolin A. J. Am. Chem. Soc. 2020, 142, 7306.
- Boudný, M.; Zemanová, J.; Khirsariya, P.; Borský, M.; Verner, J.; Černá, J.; Oltová, A.; Šeda, V.; Mráz, M.; Jaroš, J.; Kašparková, M.; Jašková, Z.; Spunarová, M.; Brychtová, Y.; Souček, K.; Drápela, S.; Mayer, J.; Paruch, K.; Trbušek, M. Novel Chk1 inhibitor MU380 exhibits significant single-agent activity in TP53-mutated chronic lymphocytic leukemia cells. Haematologica 2019, 104, 2443.
- Němec, V.; Hylsová, M.; Maier, L.; Flegel, J.; Sievers, S.; Ziegler, S.; Schröder, M. Berger, B.-T.; Chaikuad, A.; Valčíková, B.; Uldrijan, S.; Drápela, S.; Souček, K.; Waldmann, H.; Knapp, S.; Paruch, K. Furo[3,2-b]pyridine: A novel privileged scaffold for highly selective kinase inhibitors and effective modulators of the Hedgehog pathway. Angew. Chem. Int. Ed. 2019, 58, 1062.
