Kateřina Jiráková
Junior Researcher
Mechanobiology of Disease
Náš tým zkoumá základní mechanismy a převádí výsledky z laboratoře do klinické praxe — propojení preklinických modelů s klinickou perspektivou.
Výzkumný pracovník ICRC se zaměřením na translační medicínu. Propojuje preklinické poznatky s klinickou praxí napříč programy kardiologie, neurologie a onkologie.
Aktuálně vede / přispívá do interdisciplinárních projektů spojujících molekulární biologii, zobrazování a péči o pacienty ve Fakultní nemocnici u sv. Anny v Brně.
Výzkumná skupina
- Velikost týmu
- Velikost týmu: 22 výzkumníků
- Místo
- Místo: Building B1, 4th Floor
- Spolupracuje s
- Spolupracuje s Charles University, Prague
Vedoucí výzkumné skupiny
- Giancarlo Forte, Ph.D.
Členové
Bc. Branislav Brozmann
Junior Researcher
Bc. Tereza Bílková
Junior Researcher
Mgr. Nikola Kaštánková
Ph.D. Student
Bacel Aldabash, MSc
Ph.D. Student
Gokula Narayanan Suryanarayanan
Ph.D. Student
Prosenjit Chakraborty, MSc
Ph.D. Student
Marco Cassani, Ph.D.
Senior Researcher, Principal Investigator
Giancarlo Forte, Ph.D.
Researcher, Senior Research Team Leader
Mgr. Martina Tatíčková
Researcher
Mgr. Helena Skálová
Research Technician, Research Coordinator
Mgr. Zuzana Garlíková, Ph.D.
Postdoctoral Researcher
Ivana Aćimović, Ph.D.
Postdoctoral Researcher
RNDr. Jan Fröhlich, Ph.D.
Principal Investigator, Senior Postdoctoral Researcher, Senior Research Specialist
Dr. Soraia Margarida Da Silva Teixeira Fernandes
Principal Investigator
Stefania Pagliari, Ph.D.
Senior Postdoctoral Researcher
Mgr. Bc. Vladimír Vinarský, Ph.D.
Senior Postdoctoral Researcher
Mgr. Pavel Šimara, Ph.D.
Senior Postdoctoral Researcher
Mgr. Jan Vrbský, Ph.D.
Senior Postdoctoral Researcher
MUDr. Danica Zapletalová, Ph.D.
Research Specialist
MUDr. Pavel Tinka
Research Specialist
Asistent týmu
Romana Vlčková
Administrativní podpora
Hlavní cíle
- Charakterizace potenciálních buněčných mechanosensorů, které se mohou účastnit při vzniku srdečních patologií ale sloužit také jako vhodné jako biomarkery onemocnění.
- Identifikace nových molekulárních procesů zapojených do získávání srdečního fenotypu.
- Vytváření cenných in vitro modelů srdečních chorob.
Zaměření výzkumu
Skupina Mechanobiology of Disease (MBD) je zaměřena na výzkum poruch kardiovaskulárního systému s využitím tkáňových a buněčných modelů, na kterých vědci odhalují mechanobiologické změny doprovázející patologické stavy v průběhu stárnutí, rozvoje srdečních chorob a rakoviny. Pracovní hypotézou skupiny MBD je zjištění, že defekty senzorického aparátu, jímž buňky vnímají, a tedy reagují na vnější mechanické podněty – „mechanosnímací aparát; mochanozom“ – přispívají k patologiím spojeným se stárnutím.
S využitím moderních přístupů mikrofluidiky a technologie mikrovzorování výzkumníci MBD modifikují jednotlivé komponenty mechanozomu dospělých srdečních buněk pocházejících ze srdeční tkáně pacientů se srdečními chorobami, ale také pluripotentních kmenových buněk a kardiomyocytů z nich diferencovaných, a sledují zde efekty vedoucí ke změnám jeho funkce. Mezi další významné nástroje které při studiu používáme patří pokročilé zobrazovacích metody, separace jednotlivých typů buněk podle vybraných parametrů a detailní analýzy na úrovni genové exprese a proteinů.
Technologické vybavení
- Laboratorní vybavení pro třídění buněk, analýzu a charakterizaci tkání:
- Průtokový cytometr, třídič buněk, multifotonový mikroskop, magnetický separátor buněk, bioreaktory a přístroje pro dynamickou stimulaci a smršťování srdečních buněk, mikrofluidní zařízení, konfokální laserový skenovací mikroskop vhodný pro živé zobrazování, konfokální mikroskop se zvýšeným rozlišením, systém PCR v reálném čase a elektroforetické vybavení.
Vybrané výsledky
- Perestrelo AR, Silva AC, Oliver-De-La-Cruz J, Martino F, Horváth V, Caluori G, Polanský O, Vinarský V, Azzato G, de Marco G, Žampachová V, Skládal P, Pagliari S, Rainer A, Pinto-do-Ó P, Caravella A, Koci K, Nascimento DS, Forte G. Multiscale Analysis of Extracellular Matrix Remodeling in the Failing Heart. Circ Res (2021) DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.120.317685
- Oliver-De La Cruz J, Nardone G, Vrbsky J, Pompeiano A, Perestrelo AR, Capradossi F, Melajová K, Filipensky P, Forte G.Substrate mechanics controls adipogenesis through YAP phosphorylation by dictating cell spreading. Biomaterials 2019. doi: 10.1016/j.biomaterials.2019.03.009.
- Nardone G, Oliver De La Cruz J, Vrbsky J, Martini C, Pribyl J, Skládal P, Pešl M, Caluori G, Pagliari S, Martino F, Maceckova Z, Hajduch M, Sanz-García A, Pugno NM, Stokin GB, Forte G. YAP regulates cell mechanics by controlling focal adhesion assembly. Nat Commun 2017. doi:10.1038/ncomms15321.
- Pagliari S, Vinarsky V, Martino F, Perestrelo AR, Vrbsky J, Oliver-De-La-Cruz J, Caluori G, Skladal P, Zampachova V, Kytyr D, Grassi G, Sampaolesi M, Rainer A, Forte G. YAP-TEAD control of human pluripotent stem cell mechanics guides cardiogenic mesoderm specification. Cell Death Differ (2020) DOI:10.1038/s41418-020-00643-5.
- Martino F, Perestrelo AR, Hejret V, Durikova H, Horvath V, Cavalieri F, Caruso F, Albihlal WS, Gerber AP, O’Connell MA, Pagliari S, Forte G. The mechanical regulation of RNA binding protein hnRNPC in the failing heart. BiorXiv 2021, https://doi.org/10.1101/2021.08.27.457906.
- Ergir E, Oliver De La Cruz J, Fernandes S, Cassani M, Niro F, Pereira Sousa D, Vrbsky J, Vinarsky V, Perestrelo AR, Debellis D, Cavalieri F, Pagliari S, Redl H, Ertl P, Forte G. Generation and Maturation of Human iPSC-derived Cardiac Organoids in Long Term Culture. BiorXiv 2022, doi: https://doi.org/10.1101/2022.03.07.483273.
- Mosqueira D, Pagliari S, Uto K, Ebara M, Romanazzo S, Escobedo-Lucea C, Nakanishi J, Taniguchi A, Franzese O, Di Nardo P, Goumans MJ, Pinto-do-Ó P, Aoyagi T, Forte G. Hippo pathway effectors control cardiac progenitor cell fate by acting as dynamic sensors of substrate mechanics and nanostructure. ACS Nano (2014) 8: 2033-2047.
