MUDr. Jakub Fischer
Ph.D. Student
Cellular and Molecular Immunoregulation
Náš tým zkoumá základní mechanismy a převádí výsledky z laboratoře do klinické praxe — propojení preklinických modelů s klinickou perspektivou.
Výzkumný pracovník ICRC se zaměřením na translační medicínu. Propojuje preklinické poznatky s klinickou praxí napříč programy kardiologie, neurologie a onkologie.
Aktuálně vede / přispívá do interdisciplinárních projektů spojujících molekulární biologii, zobrazování a péči o pacienty ve Fakultní nemocnici u sv. Anny v Brně.
Výzkumná skupina
- Velikost týmu
- Velikost týmu: 19 výzkumníků
- Místo
- Místo: Building B1, 4th Floor
- Spolupracuje s
- Spolupracuje s Charles University, Prague
Vedoucí výzkumné skupiny
- Mgr. Jan Frič, Ph.D., MHA
Členové
Mgr. Gabriela Blažková
Ph.D. Student
Mgr. Zuzana Tomášiková
Ph.D. Student
Ioanna Papatheodorou, MSc
Ph.D. Student
Mgr. Martina Jurásková
Research Technician
Dr. Michal Pawel Santocki
Postdoctoral Researcher
RNDr. Ing. Andrea Korimová, Ph.D.
Postdoctoral Researcher
Mgr. Pavla Ďásková
Research Nurse
Kamila Ondráčková, DiS.
Research Nurse
Mgr. Kamila Bendíčková, Ph.D.
Principal Investigator, Senior Research Coordinator
Mgr. Marcela Hortová Kohoutková, Ph.D.
Principal Investigator, Senior Postdoctoral Researcher
Mgr. Petra Lázničková, Ph.D.
Senior Postdoctoral Researcher
Bc. Roman Korablev
Lab Technician
Mgr. Tereza Szotkowská
Lab Technician
Bc. Tereza Slamečková
Lab Technician
Bc. Barbora Bieleková
Lab Technician
MUDr. Martin Helán, Ph.D.
Senior Research Specialist, Research Specialist
Mgr. Jan Frič, Ph.D., MHA
Senior Research Team Leader
Asistent týmu
Romana Vlčková
Administrativní podpora
Hlavní cíle
- Popis úlohy TLR receptorů při akutní imunitní odpovědi, chronickém zánětu a regeneraci tkání pomocí mukózních 3D organoidů a imunitních buněk.
- Charakterizace dynamických změn imunitního systému během nástupu a progrese septického šoku. Dlouhodobé změny imunity způsobené septickým šokem.
- Popis molekulárního propojení mezi vrozenou imunitní signalizací a metabolickými změnami v myeloidních buňkách.
- Popis mechanismů odpovědných za nástup vrozené imunitní paměti jako nástroje ke snížení náchylnosti pacientů k respiračním infekcím.
- Rozvíjet translační výzkum v oblasti imunosenescence a zánětu prostřednictvím analýzy různých kohort starších osob, pacientů s chronickými zánětlivými poruchami a dětí, které přežily nádorová onemocnění.
- Mechanismus kontrolující aktivaci imunitního systému u chronických zánětů (např. Crohnova choroba)
Zaměření výzkumu
Náš výzkumný tým se zaměřuje na různé aspekty lidské imunitní odpovědi především na propojení základních mechanismů imunity a signalizace imunitních buněk s vývojem poruch a patologií. Hlavní témata jsou (i) role imunitní odpovědi v progresi sepse a septického šoku, včetně studia dlouhodobých následků; (ii) studium stárnutí imunitního systému a charakterizace imunosenescentního fenotypu u řady kohort pacientů včetně přeživších onkologických onemocnění nebo u pacientů s neurodegenerativním onemocněním či chronickými kardiovaskulárními problémy; (iii) 3D modely lidských mukózních tkání umožňující studium imunitní odpovědi v mikroprostředí. (iv) signalizace imunitních buněk, především úloha calcineurin-NFAT dráhy ve vzniku susceptibility k infekcím. (v) imunometabolismus jako řídící mechanismus imunitní odpovědi
Naše úzká spolupráce s lékaři vytváří příležitost k provedení základního výzkumu se silným translačním přístupem podle přístupu od zkumavky k lůžku (from bench to bedside).
Náš tým spolupracuje s řadou partnerů: Department of Pathophysiology, Third Faculty of Medicine, Charles University in Prague, Czech Republic; Veterinary Research Institute, Brno; Institute of Hematology and Blood Transfusion in Prague; Czech Centre for Phenogenomics, Institute of Molecular Genetics, Prague; Central European Institute of Technology, Brno; University of Perugia, Italy; Latvian Institute of Organic Synthesis, Riga
Technologické vybavení
- Flow Cytometry Facility přizpůsobená ke komplexní analýze a izolaci buněk (MoFlo Astrios, Spektrální cytometr SONY SA3800)
- Magnetický buněčný separátor (AutoMACS, Miltenyi) vhodný k automatické a rychlé separaci a obohacení buněčných populací s velkou čistotou.
- Multifotonový Mikroskop vhodný k analýze celé tloušťky tkáňových explantátů a 3D kultur.
- Konfokální Laserový Scanovací Mikroskop vhodný pro zobrazování živých buněk.
Vybrané výsledky
- CMI skupina publikovala řadu článku v prestižních časopisech (Mucosal Immunology, Cell Reports, EMBO Molecular Medicine and Leukemia) popisující důležité mechanismy vývoje myeloidních buněk a imunitní obranyschopnosti proti různým patogenům. V rámci výzkumu CMI skupina také prokázala, že imunosupresivní léky (jako například Cyclosporine A or Tacrolimus) ovlivňují funkci Calcineurin – NFAT signální dráhy v myeloidních buňkách a jejich prekurzorech, což způsobuje dysregulaci myelopoézi a zvýšenou náchylnost k infekcím. Tyto výsledky jsou důležité k pochopení komplikací spojených s imunosupresivní léčbou.
- Mezi vybrané publikace patří:
- Lázničková P et al: Childhood survivors of high-risk neuroblastoma show signs of immune recovery and not immunosenescence. Eur J Immunol.2020 Aug 3. doi: 10.1002/eji.202048541;
- Hortová-Kohoutková M et al: Phagocytosis-inflammation Crosstalk in Sepsis: New Avenues for Therapeutic Intervention. Shock.2020 Jun 8. doi: 10.1097/SHK.0000000000001541;
- Bendíčková K et al: Roles of IL-2 in bridging adaptive and innate immunity, and as a tool for cellular immunotherapy. J Leukoc Biol.2020 Jul;108(1):427-437. doi: 10.1002/JLB.5MIR0420-055R;
- Jose SS et al: Comparison of two human organoid models of lung and intestinal inflammation reveals Toll-like receptor signalling activation and monocyte recruitment. Clin Transl Immunology.2020 May 5;9(5):e1131. doi: 10.1002/cti2.1131;
- Bendíčková K et al: Calcineurin inhibitors reduce NFAT-dependent expression of antifungal pentraxin-3 by human monocytes. J Leukoc Biol.2020 Mar;107(3):497-508. doi: 10.1002/JLB.4VMA0318-138R;
- Mencarelli A et al: Calcineurin-mediated IL-2 production by CD11chighMHCII+ myeloid cells is crucial for intestinal immune homeostasis. Nat Commun. 2018 Mar 16;9(1):1102. doi: 10.1038/s41467-018-03495-3;
- Bendíčková K et al: Calcineurin-NFAT signalling in myeloid leucocytes: new prospects and pitfalls in immunosuppressive therapy. EMBO Mol Med.2017 Aug;9(8):990-999. doi: 10.15252/emmm.201707698;
- Zelante T et al: Impaired calcineurin signaling in myeloid cells results in downregulation of pentraxin-3 and increased susceptibility to aspergillosis. Mucosal Immunol.2017 Mar;10(2):470-480. doi: 10.1038/mi.2016.52.
